آنالیز بیوانفورماتیکی حساسیت زایی پروتئینهای جدید در موجودات تراریخته

موجودات تراریخته اهمیت، کاربرد و گستره وسیعی در زیست فناوری دارند. گیاهان تراریخته در دهه اخیر به منظور تولید مواد غذایی و مصارف صنعتی رشد و توسعه قابل توجهی داشته اند. چراکه استفاده از گیاهان و محصولات تراریخته با توجه به محدودیتهای افزایش سطح زیر کشت، راه حلی کلیدی پاسخ به تقاضای روزافزون غذا در جهان است. از اینرو ایمنی مصرف محصولات تراریخته یکی از ضروریات مهم به شمار می رود. یکی از مهم ترین موارد ایمنی، اطمینان از حساسیت زا نبودن (غیر آلرژن) پروتئین های جدید در موجودات تراریخته است. آلرژی و آلرژن ها حدود یک سوم جمعیت جهان را تحت تاثیر قرار داده اند. آلرژن پروتئین یا گلیکوپروتئینی است که بوسیله سیستم ایمنی افراد دارای حساسیت شناسایی می شود. تا کنون حدود 1600 آلرژن شناسایی شده اند. آنالیزهای بیوانفورماتیکی یکی از ابزارهای کارآمد و اولیه برای تعیین آلرژنیسیته پروتئین های جدید به شمار می آیند. این کار بوسیله پایگاه های اطلاعاتی آلرژن ها با قابلیت جستجو و محاسبه میزان مشابهت توالی پروتئین جدید با پروتئینهای آلرژن قبلی صورت می گیرد. براساس مقررات بین المللی این محاسبه مشابهت در سه سطح توالی کامل، توالی 80 اسیدآمینه ای (دامنه) و توالی 6 تا 8 اسیدآمینه ای انجام می شود. درجه تاثیر و سودمندی آنالیزهای بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته موجودات تراریخته جدید، ارتباط مستقیمی با ماهیت و محتوای پایگاه های اطلاعاتی دارد که در تحلیل از آن استفاده می شود. اخیرا تعداد پایگاه های اطلاعاتی آلرژن ها افزایش یافته اند و هر کدام نیازهای خاصی را برآورده می سازند. این پایگاه های اطلاعاتی در حجم داده ها، سازماندهی و قابلیت ها تفاوت دارند. در این مقاله ضمن معرفی اجمالی پایگاه های اطلاعاتی حاوی آلرژن ها، شامل iuis ، allallergy، afds، a allergome، informall، allergopharma، sdap، evaller،allerdb ، biopep آنالیز بیوانفورماتیکی توالی های پروتئینی به منظور بررسی آلرژنیسیته با استفاده از این پایگاه ها نیز تبیین گردیده است.